原基础设计采用静压预应力管桩，由于金沙洲地域属石灰岩岩土，场地上层为软弱层，下伏基岩为灰质岩，土质较为复杂，经6次试桩，尽管采取了多项技术措施（包括降低单桩承载力设计值、增加桩身壁厚及桩靴钢板厚度、减慢压桩速度等），断桩率仍高达60%，无法满足施工要求。为此进行了改变基础。基础形式选定为：6层高的建筑改用复合地基，即施工时先打直径为500hn1djzhn1djz@1000的砂桩处理地下流塑，对地质进行改良后，再施工直径为500hn1djzhn1djz@1000的水泥搅拌桩，形成水泥砂土复合搅拌桩加砂桩与桩间土构成三元复合地基；桩承台则改为筏式基础。高层建筑则采用冲孔桩基础。冲孔灌注桩为端承桩，桩径D＝600hn1djzhn1djz，混凝土强度等级C30，桩端支撑岩为微分化岩，要求桩端嵌入该岩层，入岩深度≥0.9hn1djz。总共数量834根。同时对溶洞、土洞采取了回填、灌浆等有效地处理措施，在倾斜岩面上采取措施防止偏锤、卡锤等质量隐患。